Ассоциация между человеческими лейкоцитарными антигенами (HLA) и туберкулезом
Ассоциация между
человеческими лейкоцитарными антигенами (HLA) и туберкулезом
Резюме
Легочный туберкулез развивается как сложная комбинация
между экологическими факторами и генетической восприимчивостью. В данном
исследовании ассоциация между человеческими лейкоцитарными антигенами (HLA) и
туберкулезом была изучена в нескольких популяциях, но результаты оказались
противоречивыми.
Предполагаемая оценка II класса HLA проводилась методом
полимеразной цепной реакции (ПЦР) с помощью набора специфических праймеров и
олигонуклеотидов в мексиканской популяции.
Исследование проводилось Клинической службой Туберкулеза
и Отделом иммунологии, Национальном институте респираторных болезней, Мексика.
В качестве обследуемых были четыре группы пациентов: 95
здоровых; 50 неиммуносупрессированных пациентов с туберкулезом легких; 15 ВИЧ-инфицированных
пациентов с туберкулезом; 37 ВИЧ-инфицированных пациентов в асимптотической
стадии.
В результате исследования были получены данные: частоты
аллелей DQA1*101, DQB1*501, DRB1*1501 были значительно увеличены у
неиммунодепрессированных пациентов с туберкулезом легких по сравнению со
здоровыми пациентами. В отличие от этого, частоты аллелей DQB1*402, DRB1*4 и DRB1*8
были значительно уменьшены у пациентов с туберкулезом. Также, значительное
увеличение частоты аллеля DRB1*1101 было обнаружено у ВИЧ-положительных
пациентов.
Генетическое влияние, связанное с системой HLA играет
важную роль в развитии туберкулеза легких. Хотя эта восприимчивость, возможно,
не играет у роли у пациентов, с серьезными нарушениями иммунной системы
(такими, как ВИЧ-инфекция).
Введение
Туберкулез остается одной из важнейших мировых проблем.
По приблизительным оценкам примерно треть населения заражена Mycobacterium
tuberculosis. Около 8 миллионов случаев активного туберкулеза и 2,9 миллионов
смертей регистрируется каждый год.
Болезнь приблизилась к эпидемическим пропорциям с
ухудшением окружающей среды, социоэкономических условий, таких как перенаселение,
неправильное питание и расположение сточных вод. Также, в последнее время
эпидемическая картина ассоциирована с ВИЧ.
Однако, исследования, выполненные на людях и лабораторных
животных, доказывают, что в дополнение к окружающей среде генетическая
предрасположенность может играть роль в прогрессировании заболевания. Недавно
открыто, что изменения генетической информации для ассоциированного с
врожденным иммунитетом протеина I макрофага связаны с восприимчивостью к туберкулезу
у жителей Западной Африки.
Главный комплекс гистосовместимости человека играет
важную роль в формировании иммунного ответа. Возможная ассоциация между
антигенами HLA и туберкулезом исследована на многих популяциях, но результаты
оказались противоречивыми. Несоответствия могут быть связаны с
методологическими проблемами, потому что исследования были сделаны главным
образом серологическими методами, которые могут давать перекрестные реакции и
иметь низкую специфичность. Кроме того, серологические методы дают ошибочные
значения HLA класса II более чем в 25% случаев по сравнению с более точным
методом ДНК-типирования. Также восприимчивость к туберкулезу находится под
многофакторным генетическим контролем, включающим и контроль за системой HLA.
HLA регион находится на коротком плече шестой хромосомы и
делится на три региона: HLA класса I, кодирующий HLA-A, -B, -C антигены; HLA
класса II, кодирующий HLA-DR, DQ и DP антигены; HLA класса III, кодирующий
второй и четвертый компоненты комплемента С2 и С4, фактор B, туморонекротический
фактор α и β, белок теплового шока 70 и 21-гидроксилазу. Гены классов
I и II кодируют поверхностные клеточные гликопротеины, функция которых
презентовать антигенные пептиды для CD8+ CD4+ клеток, играющих фундаментальную
роль в гомеостазе.
Система HLA – самая полиморфная биологическая система, и
популяционные различия представлены частотами специфических аллелей и подтипов,
а также их комбинацией. HLA-система рестриктирует Т-клетки и тесно связана с
генами иммунного ответа и супрессии. Ответ антиген-специфических Т-клеток
связан с презентацией процессированного пептида в ассоциации с поверхностными
гликопротеинами МНС класса I и II. В частности, белки, кодированные генами МНС
класса II, функционируют как рестриктирующий элемент, который опосредует
узнавание антигена регуляторными Т-клетками, и тесно связаны с иммунным
распознаванием и ответом.
Цель данного исследования – сравнить частоту генов HLA
класса II у взрослых с туберкулезом легких и здоровых людей метом полимеразной
цепной реакции. Также были исследованы ВИЧ-положительные пациенты с
туберкулезом или без него.
Материалы и методы. Исследование популяции
В исследование были включены пятьдесят случайно
отобранных неиммунодепрессированных пациентов с туберкулезом легких. Пациенты, не
связанные родственными связями, являлись коренными жителями Мехико, были
госпитализированы в Национальный институт респираторных болезней во время
исследования. Во всех случаях диагноз туберкулеза был поставлен на основе
световой микроскопии, с помощью которой обнаруживалось присутствие
кислотоустойчивых бацилл в мокроте, а также культуральным высевом M.
tuberculosis.
Чтобы признать пациентов неиммунодепрессированными, они
были оценены по следующим критериям: отсутствие ВИЧ-инфекции; нормальное
количество лимфоцитов и Т-клеток в периферической крови; подтвержденный
легочной туберкулез. Пациенты с диабетом, силикозом, циррозом печени или
другими системными заболеваниями, а также пациенты, злоупотребляющие алкоголем,
не были включены в исследование. Пациенты со СПИДом исследовались независимо.
В качестве контроля исследовались 95 не связанных
родством здоровых пациентов, отобранные по этническим и социоэкономическим
особенностям; 37 ВИЧ-инфицированных пациентов без туберкулеза и других инфекций
(2-я стадия ВИЧ-инфекции по классификации Центра по контролю и предотвращению
инфекций CDC). Дополнительно исследовались 15 ВИЧ-инфицированных пациентов с
туберкулезом (4-я стадия ВИЧ-инфекции по CDC) и 20 здоровых не
ВИЧ-инфицированных гомосексуальных пациентов. Диагноз ВИЧ ставился по методу
ИФА и подтверждался с помощью метода иммуноблотинга. Пациенты и контроль
родились в Мексике и имеют три поколения предков, коренных жителей Мексики.
Исследование было одобрено Научным и Этическим комитетом, было получено
согласие всех обследуемых.
Проект исследования
Геномная ДНК из цельной крови, содержащей этилендиаминтетраацетат
была извлечена с помощью стандартных методик. ДНК амплификация и специфическая
идентификация аллелей HLA-DQ осуществлялись с помощью метода ПЦР с набором
специфических праймеров (Bio-Sinthesis; Dallas, TX). Идентификация HLA-DRB1
проводилась с помощью специфических последовательностей олигонуклеотидов
методом обратной гибридизации dot blot (Amplicor kit; Hoffman La Roche; Базель, Швейцария). DR1, DR2, DR4, DRB1-DR52, DRB3 и DRB5 амплификация проводилась
методом ПЦР с использованием Taq-полимеразы (Promega; Madison, WI). Праймеры,
используемые для амплификации: DRBAMP-B для региона 3’ из экзона 2, и DRBAMP-1, DRBAMP-2, DRBAMP-3 DRBAMP-4, DRBAMP-5 и DRBAMP-52 для региона 5’ из экзона 2. Они были синтезированы на автоматическом синтезаторе (DNA-SM; Beckman; Пало-Альто,
Калифорния).
Статистический анализ
После того, как были определены частоты фенотипов для
каждых аллелей в исследуемой и контрольной популяциях, различия были
установлены и подтверждены с помощью критерия χ2. Риск развития
туберкулеза был проверен с помощью компьютерной программы (STATA и Windows 95;
Microsoft; Редмонд, WA).
Результаты
Исследование включало 50 неиммунодепрессированных
пациентов (средний возраст 39,1±13,0 лет). В контроль были включены 95 здоровых
человек (35,4±10,1 лет); 37 ВИЧ-инфицированных пациентов, не зараженных
туберкулезом и не имеющих новообразований; 15 иммунодепрессированных пациентов
(ВИЧ-инфицированных) с туберкулезом (31,1±5,7 лет); 20 здоровых не
ВИЧ-инфицированных гомосексуалистов (26,3±8,5 лет). Поздняя группа контроля не
имела существенных отличий в фенотипе HLA с группой несвязанных здоровых людей.
С помощью метода ПЦР и гибридизации были показаны
различия между частотами аллелей неиммунодепрессированных пациентов с активным
туберкулезом и пациентами из других групп. Различия частот в каждой группе
показаны в таблице 1. Среди 50 неиммунодепрессированных пациентов с
туберкулезом было 30 пациентов с аллелем DQA1*0101, 22 с аллелем DQB1*0501 и 24
с аллелем DRB1*1501 (по сравнению с контрольной группой из 95 человек: 20, 12 и
9 человек соответственно).
ВИЧ-инфицированные пациенты показали высокие частоты аллеля
DRB1*1101.
С другой стороны три аллеля ассоциированы с протекцией
против туберкулеза: DQB1*0402, DRB1*4 и DRB1*8 (таблица 1).
Обсуждение результатов
Молекулярное типирование оказалось полезным для
определения ассоциации между системой HLA и туберкулезом. Этот метод оказался
более удобным, чем серологический. В данном исследовании метод ПЦР в сочетании
со специфическими олигонуклеотидными пробами показали ассоциацию между генами DQA1*0101,
DQB1*0501, DRB1*1501 и восприимчивостью к туберкулезу. Эти маркеры
восприимчивости определялись независимо друг от друга, поэтому речь не идет о
гаплотипе. Интересно, что ВИЧ-инфицированные пациенты с туберкулезом не имели
данных генов. Предполагается, что приобретение серьезного иммунодепрессивного
статуса предрасполагает к развитию туберкулеза, независимо от генетической
составляющей. Однако размер этой группы был слишком мал, чтобы делать
какие-либо заключения, и необходимы дальнейшие исследования больших групп
ВИЧ-инфицированных пациентов с туберкулезом. Вдобавок частоты некоторых аллелей
HLA DR и DQ локусов у здорового контроля были значительно увеличены по
сравнению с частотами HLA у пациентов с туберкулезом, что можно связать с тем,
что эти аллели могут вносить вклад в устойчивость к данному инфекционному
заболеванию.
Недавние исследования пациентов с туберкулезом из Индии
показали ассоциацию с геном HLA DRB1*2, но большая часть данных аллелей
DRB1*1501 и DRB1*1502 была одновременно и у пациентов и у контроля.
Распределение генов HLA DQ в данном исследовании изучено не было. Позднее была
найдена ассоциация между HLA DQB1*503 и клиническим туберкулезом у пациентов из
Камбоджи. В этом исследовании было также отмечено небольшое увеличение частоты
встречаемости аллеля HLA-DRB1*2.
HLA-DQ молекулы уникальны среди II класса молекул МНС,
потому что обе α- и β-цепочки очень полиморфны; более того, многие
вариабельные аминокислотные остатки расположены в α-спиральной части
антиген-связывающего кармана. С помощью ПЦР анализа было выявлено два гена DQ
аллеля, связанных с туберкулезом.
Также риском к развитию легочных и экстрапульмонарных
заболеваний являются воздействия окружающей среды и первоначальный результат
воздействия микобактерий на организм. Хотя факторы, которые влияют на развитие
болезни и ее клиническое проявление, еще недостаточно изучены. В частности, при
воздействии микобактерий на организм не всегда происходит заражение; а среди
зараженных прогрессирование в активное заболевание, причины болезни и ее длительность
сильно варьируют. Наиболее вероятно, действует сложный комплекс генетических и
экологических факторов. Хорошо известно, что плохие окружающие условия и
некоторые идентифицированные факторы риска: диабет, силикоз, ВИЧ,
злоупотребление алкоголем и другие, - все они играют роль в предрасположенности
к туберкулезу. В данном исследовании семейный статус и правильное питание, известные
кофакторы в развитии туберкулеза, были одинаковыми в контрольной группе и
группе пациентов с туберкулезом; пациенты с некоторыми из вышеупомянутых
нарушений были исключены из группы больных с туберкулезом, а ВИЧ-инфицированные
пациенты с туберкулезом анализировались отдельно.
Генетические факторы хозяина могут оказывать влияние и на
восприимчивость к инфекционному агенту, и на патогенез заболевания, хотя
получить свидетельство генетической предрасположенности к туберкулезу довольно
сложно. Недавно были получены данные, что вариации в протеине I человеческих
макрофагов, который ассоциирован с врожденным иммунитетом, связаны с измененной
чувствительностью к мокрото-положительным туберкулезом у населения Западной
Африки.
Результаты исследований, как и данные Goldfeld и др.,
показывают, что некоторые аллели системы HLA II класса, особенно локуса DQ1,
могут принимать участие в возрастании чувствительности и в восприимчивости к
туберкулезу. HLA-рестриктированная презентация процессированных антигенов
альвеолярными макрофагами может быть изменена у пациентов, экспрессирующих
данные специфические аллели HLA.
Также было обнаружено возрастание частоты DRB1*1101
аллеля у ВИЧ-инфицированных пациентов. При использовании стандартного метода
микроцитотоксичности на мононуклеарных клетках несколько лет назад была
получена высокая частота встречаемости гена HLA-DR5 у ВИЧ-инфицированных
пациентов. Однако неясно, предрасполагал ли ген HLA-DR5 к развитию ВИЧ-инфекции
или к некоторым последующим осложнениям, таким как постоянная генерализованная
лимфоаденопатия или саркома Капоши. После того, как было доказано, что частота
DRB1*1101 была значительно увеличена на II стадии ВИЧ-инфекции по CDC,
результаты исследования доказывали: генетическая восприимчивость, связанная с
этим маркером, предрасполагает пациентов к ВИЧ-инфекции, а не к вышеописанным
осложнениям. В доказательство данной точки зрения было исследовано 20
мужчин-гомосексуалистов без ВИЧ-инфекции по HLA II класса. Частота аллеля HLA
DRB1*1101 в этой группе не отличается от контрольной группы. Однако эти данные
нужно использовать осторожно, так как несмотря на многие исследования
относительно типа HLA и иммунного ответа на ВИЧ-I, вопрос о том, влияет ли HLA
на восприимчивость к данной вирусной инфекции остается нерешенным.
Проведенные исследования доказывают, что три аллеля HLA
вовлечены в восприимчивость к туберкулезу в мексиканской популяции.
Механизмы, лежащие в основе неустойчивости или
восприимчивости к инфекционным заболеваниям, связанные с HLA II класса, а также
различия между DR и DQ локусами до сих пор до конца не изучены. Хотя результаты
исследования подтверждают, что генетическое влияние системы HLA может играть
роль в развитии туберкулеза, но эта предполагаемая чувствительность не играет
роли у пациентов с серьезными нарушениями иммунитета, как во время
ВИЧ-инфекции. Также было предположено, что ген DR5 может быть ассоциирован с
развитием ВИЧ-инфекции.
Таблица 1. Частоты генов HLA в четырех группах пациентов
Allele Specificity
|
Healthy Subject
|
PTB Patients, %
|
HIV-Positive Patients, %
|
AIDS Patients with PTB, %
|
DR1
|
10.52
|
20.00
|
5.40
|
6.66
|
DR3
|
12.63
|
20.00
|
16.21
|
13.33
|
DR4
|
46.31
|
12.00
|
13.51
|
33.33
|
DR7
|
22.10
|
18.00
|
16.21
|
33.33
|
DR8
|
33.68
|
4.00
|
18.91
|
6.66
|
1.05
|
8.00
|
5.40
|
6.66
|
DR10
|
1.05
|
4.00
|
0.00
|
6.66
|
DR11
|
(DRB1*1101)
|
11.57
|
24.00
|
45.94!
|
33.33
|
(DRB1*1102)
|
3.15
|
4.00
|
2.70
|
6.66
|
(DRB1*1103)
|
1.05
|
2.00
|
0.00
|
0.00
|
(DRB1*1104)
|
3.15
|
0.00
|
2.70
|
0.00
|
DR12
|
(DRB1*1201)
|
2.10
|
16.00
|
8.10
|
0.00
|
(DRB1*1202)
|
0.00
|
2.00
|
5.40
|
0.00
|
(DRB1*1203)
|
0.00
|
0.00
|
2.70
|
0.00
|
DR13
|
{DRB1*1301)
|
4.21
|
2.00
|
2.70
|
0.00
|
(DRB1*1302)
|
4.21
|
4.00
|
0.00
|
0.00
|
(DRB1*1305)
|
2.10
|
0.00
|
0.00
|
0.00
|
DR14
|
22.10
|
2.00
|
0.00
|
0.00
|
DR15
|
(DRB1*1501)
|
9.47
|
24.32
|
33.33
|
(DRB 1*1502)
|
3.15
|
0.00
|
0.00
|
6.66
|
(DRB1*1503)
|
1.05
|
0.00
|
2.70
|
0.00
|
DR16
|
(DRB1*1601)
|
2.10
|
6.00
|
27.02
|
6.66
|
(DRB1*1602)
|
3.15
|
4.00
|
0.00
|
6.66
|
DQA
|
(DQA1*0101)
|
22.10
|
62.00!
|
40.54
|
35.71
|
(DQA1*0102)
|
17.89
|
10.00
|
13.51
|
28.71
|
(DQAl*020l)
|
22.10
|
12.00
|
18.91
|
14.28
|
(DQA1*0301)
|
48.42
|
30.00
|
13.51
|
35.71
|
(DQA1*0401)
|
32.63
|
12.00
|
18.91
|
7.14
|
(DQA1*0501)
|
46.31
|
34.00
|
35.13
|
28.57
|
(DQA1*0502)
|
4,21
|
0.00
|
0.00
|
0.00
|
DQB
|
(DQBl*0201)
|
33.68
|
26.00
|
16.21
|
35.71
|
(DQB1*0301)
|
35.78
|
24.00
|
13.51
|
28.57
|
43.15
|
32.00
|
32.48
|
35.71
|
(DQB1*0304)
|
1.05
|
0.00
|
0.00
|
0.00
|
(DQB1*0402)
|
33.68
|
6.00
|
8.10
|
0.00
|
(DQB1*0501)
|
12.68
|
44.00!
|
21.62
|
31.71
|
(DQB1*0502)
|
5.26
|
6.00
|
5.40
|
7.14
|
(DQB1*0503)
|
9.47
|
4.00
|
5.40
|
14.28
|
(DQB1*0504)
|
1.05
|
0.00
|
0.00
|
0.00
|
(DQB1*0602)
|
15.78
|
14.00
|
8.10
|
0.00
|
(DQB1*0603)
|
5.26
|
0.00
|
10.21
|
7.14
|
(DQB1*0604)
|
2.10
|
8.00
|
8.10
|
7.14
|
(DQB1*0609)
|
1.05
|
0.00
|
0.00
|
0.00
|